Думаю, что можно ограничиться ежедневным (или через день) копированием виртуальных машин с данными (конфиги, базы) Lync 2013.
Если хочется более гранулярного рез. копирования, то стоит обратиться к статье "https://technet.microsoft.com/en-us/library/hh202168(v=ocs.15).aspx"
Также можно рассмотреть скрипт: "http://lyncscripts.blogspot.ru/2013/09/lync-2013-backup-script.html"
В свою очередь DPM умеет копировать виртуальные машины на базе Hyper-V, файлы и папки, базы данных SQL.