Есть предположение, что имеют место быть проблемы с Методами обнаружения (detection method), которые настраиваются в Типах развертывания в свойствах Приложения SCCM. Из Вашего скриншота это не совсем очевидно, но если смотреть по коду ошибки аналогичную ситуацию можно встретить, например здесь http://www.mssccmfaq.de/2012/06/19/installation-failed-0x87d00324/
Где описание ошибки звучит как 0x87D00324 (-2016410844) The application was not detected after installation completed.
То есть фактически приложение успешно установлено, но настроенные методы обнаружения не позволяют получить статус его установки.
То же самое подтверждает это обсуждение http://social.technet.microsoft.com/Forums/en-US/99b13d65-3305-46c7-b5a0-96513408520b/sccm-2012-deploy-error-the-software-change-returned-error-code-0x87d003242016410844?forum=configmanagerapps
Так что попробуйте поиграться с изменением настроенных методов обнаружения приложения.